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Moteurs moléculaires
Kinésines

Sommaire
définition

Les kinésines sont des protéines motrices associées aux microtubules qui assurent notamment le transport intracellulaire et participent à la dynamique des microtubules, à la mitose, à la cytokinèse et aux fonctions ciliaires.

Vue d'ensemble des kinésines

Les kinésines constituent une superfamille de moteurs moléculaires linéaires qui utilisent les microtubules comme rails et convertissent l'énergie fournie par l'hydrolyse de l'ATP en travail mécanique.

1. Chez les Mammifères, les kinésines interviennent dans de nombreuses fonctions cellulaires :

Déplacement d'une kinésine transportant un cargo le long d'un microtubule
(Vidéo : extrait de The Inner Life of the Cell - XVIVO)

2. La plupart des kinésines motrices se déplacent vers l'extrémité (+) des microtubules et assurent ainsi fréquemment un transport centrifuge ou antérograde.

Cette directionnalité n'est cependant pas une propriété universelle de la superfamille.

3. La dynéine cytoplasmique constitue l'autre grand moteur associé aux microtubules et se déplace principalement vers leur extrémité (-).

Structure des kinésines

Les kinésines fonctionnelles se présentent fréquemment sous forme de dimères, mais leur organisation structurale varie selon les familles.

La kinésine-1, modèle classique des kinésines de transport, forme un complexe constitué :

  • de deux chaînes lourdes (KHC, Kinesin Heavy Chains),
  • de deux chaînes légères (KLC, Kinesin Light Chains).

Chaîne lourde (KHC)

Chaque chaîne lourde de la kinésine-1 comprend plusieurs régions.

1. La tête globulaire est formée par le domaine moteur situé à l'extrémité N-terminale

Le domaine moteur, région fortement conservée au sein de la superfamille des kinésines, possède une architecture globulaire constituée principalement d'un feuillets β (β sheet) central entouré d'hélices α et de boucles et comprend (Glycogen synthase kinase 3β (GSK3β) and presenilin (PS) are key regulators of kinesin-1-mediated cargo motility within axons 2023) :

  • un site de liaison des nucléotides ATP/ADP,
  • des régions assurant l'interaction avec la tubuline,
  • des éléments structuraux qui transmettent les changements conformationnels provoqués par le cycle ATPasique au reste de la molécule.
Modèle de transport des endosomes
Modèle de transport des endosomes
(Figure : vetopsy.fr d'après Banerjee et Gunawardena)

Remarque : la position du domaine moteur varie selon les familles et est situé :

2. Le cou (neck), immédiatement adjacent au domaine moteur, qui comprend :

3. La tige, formée de plusieurs domaines coiled-coil (CC1 à CC4), contribue à la dimérisation des deux chaînes lourdes.

4. La queue (tail) C-terminale est impliquée dans la régulation du moteur et l'association avec les chaînes légères et les cargos.

Elle contient notamment le motif IAK (Isoleucine-Alanine-Lysine), impliqué dans l'autoinhibition de la kinésine-1.

Chaîne légère (KLC)

Les chaînes légères des kinésines (KLC, Kinesin Light Chains) sont associées à la région C-terminale des chaînes lourdes de la kinésine-1 (Kinesin-1 conformational dynamics are controlled by a cargo-sensitive TPR switch 2026).

1. Chaque chaîne légère comprend :

  • une région N-terminale contenant des répétitions heptadiques, i.e. des motifs de sept résidus favorisant la formation d'une structure coiled-coil (superhélice) et permettant l'association de la chaîne légère avec la région CC3 de la chaîne lourde et contribue ainsi à la stabilité du complexe kinésine-1,
  • une région C-terminale contenant des répétitions TPR (Tetratricopeptide Repeats), motifs structuraux impliqués dans les interactions protéine-protéine.
Kinésine 1 en conformation étendue et autoinhibée
Kinésine 1 en conformation étendue et autoinhibée
(Figure : vetopsy.fr d'après Shukla et coll)

2. Les chaînes légères :

  • BORC, Arl8b, SKIP et kinésine
    BORC, Arl8b, SKIP et kinésine
    (Figure : vetopsy.fr d'après Keren-Kaplan et coll)
    participent à la sélection et à la liaison des cargos par leur domaine TPR, directement ou par l'intermédiaire de protéines adaptatrices comme les JIP (JNK-interacting proteins), la calsynténine-1 et SKIP/PLEKHM2,
  • contribuent à la régulation de l'activité de la kinésine-1, notamment à son autoinhibition et à son activation lors du recrutement des cargos.

Cycle mécanochimique des kinésines

Dans la kinésine-1, les deux domaines moteurs identiques fonctionnent de manière coordonnée.

La kinésine-1 est un moteur processif, propriété qui permet d'effectuer plusieurs pas successifs le long d'un microtubule avant de s'en dissocier.

Remarque : la processivité et les paramètres mécanochimiques varient cependant fortement selon les familles de kinésines et peuvent être modulés par la dimérisation, les protéines associées, les cargos et les propriétés du microtubule.

Principe

Le cycle de liaison à l'ATP, d'hydrolyse de l'ATP et de libération de l'ADP modifie alternativement l'affinité des deux domaines moteurs pour le microtubule et la conformation de leur neck linker.

Cycle mécanochimique simplifié de la kinésine-1
Cycle mécanochimique simplifié de la kinésine-1
(Figure : vetopsy.fr d'après Cochran et Kull, 2008 ; Wikimedia Commons)

La liaison de l'ATP à une tête fixée au microtubule favorise l'arrimage de son neck linker et le déplacement de l'autre tête vers le site de liaison suivant.

  • Les deux têtes alternent ainsi leur position selon un mécanisme généralement décrit comme une marche hand-over-hand.
  • Chaque pas de la kinésine produit un déplacement d'environ 8 nm, correspondant à l'espacement longitudinal des dimères d'α/β-tubuline le long d'un protofilament.

Étapes

Le cycle canonique peut être décrit en sept étapes (A kinetic dissection of the fast and superprocessive kinesin-3 KIF1A reveals a predominant one-head-bound state during its chemomechanical cycle 2021).

1. Les deux têtes motrices de la kinésine libre contiennent de l'ADP (D) et ne sont pas liées au microtubule.

2. À la suite d'une rencontre avec le microtubule, l'une des deux têtes motrices contenant de l'ADP (D) se fixe au microtubule, tandis que l'autre tête, également liée à l'ADP (D), reste libre en position arrière.

La fixation de la tête motrice au microtubule :

  • met en jeu l'interface de liaison à la tubuline du domaine moteur, notamment la boucle L11 et l'hélice α4,
  • provoque une réorganisation conformationnelle du domaine moteur qui se propage de l'interface de liaison au microtubule jusqu'au site de liaison du nucléotide,
  • modifie notamment les régions switch I et switch II impliquées dans le couplage entre la liaison au microtubule et l'état du site nucléotidique.

3. Ces changements conformationnels déstabilisent la liaison du Mg-ADP et favorisent la libération de l'ADP (D) par la tête fixée au microtubule, la tête motrice passe alors à l'état sans nucléotide (Φ), caractérisé par :

  • une forte affinité pour le microtubule,
  • un neck linker mobile et non complètement arrimé au domaine moteur.
Cycle mécanochimique de la kinésine-1
Cycle mécanochimique de la kinésine-1
(Figure : vetopsy.fr d'après Zaniewski et coll)

4. Un ATP (T) se fixe dans le site nucléotidique de la tête liée au microtubule et provoque une réorganisation des régions switch du domaine moteur.

  • Cette réorganisation se transmet à la zone d'insertion du neck linker et amorce son arrimage contre la surface du domaine moteur.
  • L'arrimage du neck linker de la tête fixée au microtubule réoriente vers l'extrémité (+) la connexion de cette tête avec la région de dimérisation des deux chaînes lourdes.

5. L'ATP est hydrolysé en ADP·Pi (DP), ce qui stabilise l'arrimage complet du neck linker de la tête fixée au microtubule (Effect of the Neck Linker on Processive Stepping of Kinesin Motor 2023).

  • La seconde tête, reliée à la région de dimérisation des deux chaînes lourdes par son propre neck linker, reste libre et liée à l'ADP (D).
  • Sa mobilité est orientée préférentiellement vers l'avant et elle se déplace par diffusion jusqu'à proximité du site de liaison suivant sur le microtubule.

Remarque : à cette étape, la tête liée au microtubule se trouve dans un état ADP·Pi (DP) de plus faible affinité.

  • Si elle se détache avant que la tête libre ne se fixe au site suivant, les deux têtes se retrouvent libres et la kinésine revient à l'état 1.
  • Si la tête libre se fixe avant ce détachement, le moteur passe à l'étape 6 et poursuit son déplacement processif.

6. La tête libre située en avant se fixe sur le site suivant du microtubule et les deux têtes sont alors transitoirement liées au microtubule mais dans deux états nucléotidiques différents.

  • La nouvelle tête avant vient de se fixer et contient encore de l'ADP (D).
  • L'ancienne tête, maintenant située en arrière, contient de l'ADP·Pi (DP).

7. La fixation de la nouvelle tête avant au microtubule entraîne deux changements qui rétablissent un état équivalent à celui de l'étape 3.

  • La nouvelle tête avant libère son ADP, passe à l'état sans nucléotide (Φ) et acquiert une forte affinité pour le microtubule.
  • La tête arrière libère Pi et se détache du microtubule, ramenant la kinésine dans un état équivalent à celui de l'étape 3, mais avancée d'environ 8 nm.

Un nouveau cycle peut alors commencer.

Remarque : les déplacements des kinésines diffèrent de ceux des dynéines cytoplasmiques (loupemouvements de la dynéine versus mouvements de la kinésine).

  • La kinésine-1 présente une marche relativement régulière vers l'extrémité (+) du microtubule, avec des pas d'environ 8 nm.
  • La dynéine cytoplasmique présente un déplacement plus irrégulier vers l'extrémité (-), avec des pas de taille variable et des déplacements transitoires en sens inverse.
Pas de la kinésine et de la dynéine
Pas de la kinésine et de la dynéine
(Figure : vetopsy.fr d'après Reck-petterson et coll et Dewitt et coll)

Diversité et fonctions des kinésines

La superfamille des kinésines est classiquement divisée en 14 familles, kinésine-1 à kinésine-14, établies principalement à partir des relations phylogénétiques entre leurs domaines moteurs.

Les différentes familles présentent des architectures, des propriétés mécanochimiques et des fonctions cellulaires très diverses :

Kinésines de transport intracellulaire

Plusieurs familles de kinésines, notamment des membres des kinésines-1, -2 et -3, participent au transport antérograde des vésicules et des compartiments endosomaux et lysosomaux.

pas bien

Un même compartiment peut recruter plusieurs kinésines appartenant à des familles différentes, qui peuvent intervenir de manière coordonnée dans son transport, ce qui rend particulièrement complexe l'attribution d'un cargo ou d'un compartiment à une kinésine donnée (loupe tableau).

1. La kinésine-1 (KIF5) comprend KIF5A, KIF5B et KIF5C.

Chez les Mammifères, KIF5B est largement exprimée, tandis que KIF5A et KIF5C sont particulièrement exprimées dans le système nerveux.

Kinésines et trafic des lysosomes
Kinésines et trafic des lysosomes
(Figure : vetopsy.fr d'après Guardia et coll)

a. La kinésine-1 est un moteur dirigé vers l'extrémité (+) des microtubules qui assure le transport de nombreux cargos membranaires et non membranaires, notamment :

b. Dans les neurones, elle constitue l'un des principaux moteurs du transport axonal antérograde.

2. Les kinésines-2 (KIF3) comprennent notamment KIF3A, KIF3B, KIF3C et KIF17.

  • KIF3A s'associe à KIF3B ou KIF3C pour former des moteurs hétérodimériques qui peuvent s'associer à la protéine accessoire non motrice KAP (kinesin-associated protein, KIFAP3), impliquée notamment dans l'interaction avec les cargos, pour constituer des complexes hétérotrimériques.
  • KIF17 forme au contraire un moteur homodimérique.

Les kinésines-2 interviennent :

3. Les kinésines-3 comprennent notamment :

  • KIF1A, KIF1B, KIF1C,
  • KIF13A, KIF13B,
  • KIF14,
  • KIF16B.

a. KIF1A et KIF1B participent :

b. KIF13A et KIF13B participent notamment au trafic des endosomes de recyclage.

c. KIF14 exerce principalement des fonctions associées à la division cellulaire, notamment dans l'organisation du fuseau mitotique et la cytokinèse (loupe corps intermédiaire ou midbody).

d. KIF16B participe, seules ou en coopération avec d'autres moteurs comme la kinésine-1 (KIF5B), au trafic antérograde de différents compartiments endosomaux et lysosomaux.

Kinésines, mitose et cytokinèse

De nombreuses kinésines participent à l'assemblage, à l'organisation et au fonctionnement du fuseau mitotique.

bien

Les principales kinésines mitotiques sont présentées dans un chapitre spécifique de la page consacrée aux moteurs mitotiques, où elles sont regroupées dans deux tableaux selon la phase de la mitose au cours de laquelle elles interviennent et selon les structures mitotiques auxquelles elles sont associées.

1. Les kinésines-4 comprennent :

  • KIF4A et KIF4B,
  • KIF7,
  • KIF21A et KIF21B.

a. KIF4A intervient notamment dans l'organisation des microtubules et de la zone médiane du fuseau au cours de l'anaphase (loupeorganisation de la zone médiane).

KIF4B est un paralogue très proche de KIF4A, mais ses fonctions cellulaires propres restent beaucoup moins bien caractérisées

b. KIF7 intervient principalement dans la voie de signalisation Hedgehog au niveau du cil primaire, où elle participe à l'organisation de l'extrémité distale des microtubules ciliaires et à la régulation de la signalisation.

c. KIF21A et KIF21B participent à la régulation de la dynamique des microtubules et à leur organisation dans les cellules polarisées, notamment dans les neurones.

Activités motrices dans l'assemblage du fuseau
Activités motrices dans l'assemblage du fuseau
(Figure : vetopsy.fr d'après Heald et Khodjakov)

2. La famille des kinésines-5 est représentée chez l'Homme par KIF11/Eg5 (loupeforces d’expansion interne au fuseau central).

3. Les kinésines-6 comprennent KIF20A/MKLP2, KIF20B et KIF23/MKLP1 qui interviennent principalement dans l'organisation de la zone médiane du fuseau au cours de l'anaphase et dans la cytokinèse.

a. KIF20A/MKLP2 agit dès l'anaphase au niveau de la zone médiane du fuseau et assure notamment le transport/relocalisation du CPC (Chromosomal Passenger Complex) contenant Aurora B vers cette région.

Elle participe ensuite à la cytokinèse et se retrouve sur les flancs du corps intermédiaire (midbody).

b. KIF20B intervient davantage dans l'organisation et la maturation du midbody, notamment dans l'organisation serrée de ses microtubules, et dans le contrôle de l'abscission.

c. KIF23/MKLP1 est un composant majeur du complexe centralspindlin.

4. Les kinésines-7 sont représentées par CENP-E/KIF10.

CENP-E/KIF10 est associée au kinétochore externe exclusivement au cours de la mitose et participe à l'alignement des chromosomes et à leurs interactions avec les microtubules du fuseau.

5. Les kinésines-8 comprennent :

  • KIF18A et KIF18B
  • KIF19.

a. KIF18A participe au contrôle de la longueur et de la dynamique des microtubules kinétochoriens et contribue à l'alignement correct des chromosomes sur la plaque équatoriale.

KIF18B intervient principalement sur les microtubules non kinétochoriens, en particulier les microtubules interpolaires et astraux.

b. KIF19 intervient principalement dans le contrôle de la longueur des cils en régulant la dynamique des microtubules ciliaires.

6. Les kinésines-10 comprennet KIF22/Kid, kinésine chromosomique qui génère des forces polaires d'éjection contribuant au centrage et à l'alignement des chromosomes sur la plaque équatoriale (loupe métaphase).

4. Les kinésines-12, représentées par KIF15, participent à l'organisation et à la stabilisation du fuseau mitotique.

Elle agit comme un renfort mécanique des faisceaux de microtubules interpolaires antiparallèles au cours de leur glissement assuré principalement par Eg5/KIF11.

7. Les kinésines-14, notamment KIFC1/HSET chez l'Homme, constituent une exception importante à la directionnalité habituelle des kinésines, leur domaine moteur C-terminal assure un déplacement vers l'extrémité (-) des microtubules.

Elles participent notamment à l'organisation et à la focalisation des pôles du fuseau (loupeforces antagonistes limitant l’écartement des pôles).

Kinésines et dynamique des microtubules

Les kinésines-13 comprennent :

  • KIF2A, KIF2B, KIF2C/MCAK,
  • KIF24.
bien

Contrairement aux kinésines de transport processives, elles utilisent leur domaine moteur ATPase surtout pour déstabiliser les microtubules, agir à leurs extrémités et favoriser leur dépolymérisation.

KIF2A participe :

KIF2C/MCAK intervient dans la régulation de la dynamique des microtubules au cours de la mitose.

KIF24 intervient notamment dans le contrôle de la dynamique des microtubules du centriole et du cil primaire.

Autres familles de kinésines

Certaines familles de kinésines assurent des fonctions plus spécialisées et ne s'intègrent pas directement dans les grands groupes fonctionnels précédents.

1. Les kinésines-9, comprenant notamment KIF6 et KIF9, sont principalement associées aux cils et aux flagelles, KIF9 participant notamment à la régulation de leur motilité.

2. Les kinésines-11, comprenant KIF26A et KIF26B, sont des kinésines atypiques non motrices qui interviennent principalement dans la signalisation et l'organisation cellulaire.

  • KIF26A participe notamment à la régulation de la migration et de l'adhérence cellulaires ainsi qu'à certaines voies de signalisation impliquées dans le développement.
  • KIF26B intervient notamment dans l'organisation du cytosquelette, l'adhérence et la migration cellulaires et joue un rôle important au cours du développement embryonnaire, en particulier dans le développement rénal.

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