• Comportement du chien et
    du chat
  • Celui qui connait vraiment les animaux est par là même capable de comprendre pleinement le caractère unique de l'homme
    • Konrad Lorenz
  • Biologie, neurosciences et
    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Système endo-lysosomal : nexines du rétromère (3)
SNX27 : recyclage vers la membrane

Sommaire
  1. Vue d'ensemble du système endomembranaire
    1. Réticulum endoplasmique
    2. Appareil de Golgi
    3. Endosomes
    4. Lysosomes
    5. LRO (Lysosome-Related Organelle)
  2. Endosomes
    1. Vue d'ensemble des endosomes
      1. Difficultés de classification
      2. Devenirs des endosomes
      3. Caractéristiques des endosomes
      4. Évolution et fonctionnement des endosomes
    2. Endosomes précoces
      1. Vue d'ensemble des endosomes précoces
      2. Devenirs des endosomes précoces
        1. Voie de dégradation
        2. Voies de recyclage
      3. Composants des endosomes précoces
        1. Rab5 et ses régulateurs
          1. GEF dont Rabex
          2. GAP
        2. Rab5 et ses effecteurs
          1. APPL1/2
          2. EEA1
          3. Rabénosyne-5
        3. Complexes d'arrimage des endosomes précoces : complexe CORVET
        4. Complexe de tri et de recyclage des endosomes précoces
          1. Rétromère
            1. Structure du rétromère CSC
            2. Recrutement du rétromère CSC
            3. Fonctions du rétromère
          2. Nexines de tri
            1. Vue d'ensemble
            2. Nexines associées au rétromère
              1. Nexines du rétromère canonique (SNX/BAR)
                1. SNX1/2
                2. SNX5/6
              2. SNX3 et rétromère/SNX3
                1. Formation de tubules
                2. Reconnaissance du cargo
              3. SNX27 et rétromère/SNX7
                1. Formation de tubules
                2. Reconnaissance du cargo
                3. Recyclage vers la membrane
                4. SNX27 et pathologies
              4. Nexines autres que celles du rétromère
                1. SNX17
                2. SNX4
                3. ESCPE-1
                4. Autres nexines
          3. Complexe retriever
          4. Complexe CCC
          5. Complexe CHEVI
          6. Complexe FERARI
          7. Complexe WASH
            1. Structure et rôles
            2. Fonctionnement avec les complexes endosomaux
              1. avec le rétromère
              2. avec le retriever
              3. avec le CCC
            3. Mode d'action
    3. Endosomes de recyclage
    4. Vésicules intraluminales (ILV) et endosomes ou corps mutivésiculaires (MVE/MVB)
    5. Endosomes tardifs
    6. Système endo-lysosomal et phosphoinositides
    7. MCS (sites de contact membranaire) RE/endosomes/lysosomes
  3. Lysosomes
  4. Trafic des endosomes/lysosomes
    1. Vue d'ensemble du trafic
    2. Trafic antérograde (centrifuge) lié aux microtubules
    3. Trafic lié au cytosquelette d'actine
  5. Fusion et fission membranaire
  6. Transport membranaire
  7. Moteurs moléculaires
  8. Voies de signalisation

 

Le rétromère/SNX27 est formé par le rétromère e lié à SNX27, une nexine appartenant à la sous-famille FERM,.

bien

Cette voie recycle les cargos directement vers la membrane plasmique via le réseau de microtubules.

Vue d'ensemble du recyclage membranaire par SNX27

Le recyclage des cargos vers la membrane nécessite Rab4 et le complexe SNX-BAR.

1. SNX27 doit d'abord être recruté à la membrane grâce à son domaine PX qui se lie à PI(3,4,5)P3 ou PIP3 , probablement épaulé par son domaine FERM.

2. La liaison du domaine PDZ de SNX27 avec VPS26 :

  • recrute le rétromère,
  • augmente l'affinité pour les motifs de liaison PDZ (PDZbm).

3. Snx27 interagit :

bien

Ces interactions empêchent le cargo d'entrer dans la voie de dégradation lysosomale.

Liaison de SNX27 à VPS26

1. Le domaine PDZ de SNX7 se lie directement à VPS26, une des trois sous-unités du rétromère CSC (A unique PDZ domain and arrestin-like fold interaction reveals mechanistic details of endocytic recycling by SNX27-retromer 2014).

  • Interactions SNX27/VPS26
    Interactions SNX27/VPS26
    (Figure : vetopsy.fr d'après Ghai et coll)
    Une épingle à cheveux (β3-β4 hairpin) sur le domaine PDZ contient Leu67 et Leu74 qui entrent en contact avec la surface de VPS26A via leur insertion dans une poche hydrophobe.
  • L'interaction semble être stabilisée par deux liaisons salines impliquant Asp44 et Gln153 de chaque côté de la cavité.

2. La seule différence structurelle notable entre VPS26A et VPS26B à la surface d'interaction est que le résidu correspondant à Gln153 dans VPS26B est Thr151, qui est probablement incapable d'établir un pont salin avec le résidu Arg68 de SNX27.

Cette différence a-t-elle une pertinence biologique pour distinguer leurs fonctions ?

2. L'association entre le domaine SNX27 PDZ et VPS26 augmente l'affinité pour les motifs de liaison PDZ, (PDZbm), ce qui indique comment le tri des cargos peut être allostériquement régulé par la formation du rétromère/SNX27.

Interactions SNX27/rétromère
Interactions SNX27/rétromère
(Figure : vetopsy.fr d'après Ghai et coll)

Complexe WASH

bien

Le complexe WASH et ses interactions sont étudiés dans un chapitre spécial.

ANKRD50

1. ANKRD50 (ANKyrin-Repeat-Domain-containing protein 50) est une grosse protéine (1429 résidus) non résolue à l'heure actuelle qui comprend :

2. ANKRD50 interagit avec :

  • la sous-unité VPS29 du rétromère, par un motif C-terminal centré autour de l'acide aminé E1300,
  • Fam21 du complexe WASH, par son domaine N-terminal (D1),
  • SNX27, par son domaine PDZ C-terminal (D4)

Toutes ses interactions semblent se renforcer mutuellement, car la mutation du site de liaison de SNX27 a systématiquement diminué la liaison du complexe WASH, tandis que la mutation du site de liaison du rétromère a entraîné une réduction frappante de la liaison de SNX27 et du complexe WASH.

3. La mutation ponctuelle de l'aspartate 620 en asparagine (D620N) de VPS35, en cause dans une maladie de Parkinson héréditaire d'apparition tardive, provoque une perte d'affinité avec FAM21 (VPS35 Mutations in Parkinson Disease 2011).

ANKRD50 et ses interactions
ANKRD50 et ses interactions
(Figure : vetopsy.fr d'après Kvainickas et coll)

Rôles de SNX27 et du rétromère en pathologie

Comme SNX27 régule le recyclage de nombreuses protéines, son déréglement peut avoir de graves conséquences sur l'organisme par le dysfonctionnement de :

  • la signalisation,
  • l'autophagie,
  • la dégénérescence neuronale,
  • les cancers,
  • la pathologie virale.

Autres nexines