• Comportement du chien et
    du chat
  • Celui qui connait vraiment les animaux est par là même capable de comprendre pleinement le caractère unique de l'homme
    • Konrad Lorenz
  • Biologie, neurosciences et
    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Système endo-lysosomal : endosomes tardifs
Vue d'ensemble

Sommaire
définition

Les endosomes tardifs, comme tous les endosomes, compartiments membranaires retrouvés à l'intérieur des cellules eucaryotes, sont des organites de tri majeur du système endomembranaire qui forment un groupe hétérogène d'organites souvent considérés comme étroitement liés aux lysosomes.

Généralement, les endosomes sont classés en trois catégories (loupe vue d'ensemble des endosomes) :

Voies endosomales (CORVET, HOPS et CHEVI)
Voies endosomales (CORVET, HOPS et CHEVI)
(Figure : vetopsy.fr d'après van der Beck et coll)

Question de
nomenclature

1. Les endosomes tardifs, comme tous les endosomes, forment un groupe hétérogène d'organites, souvent considérés comme étroitement liés aux lysosomes (Endosome maturation, transport and functions 2014).

Cette voie de dégradation est souvent appelée système endosomal-lysosomal (The endosomal-lysosomal system: from acidification and cargo sorting to neurodegeneration 2015).

2. La distinction entre les endosomes tardifs et les lysosomes est difficile.

  • D'une part, au niveau moléculaire, très peu de protéines marquent sélectivement un compartiment par rapport à l'autre.
  • D'autre part, ils échangent rapidement des composants membranaires et des solutés in vivo, ce qui conduit à l'idée dominante que, lors de la fusion, ils forment un endo-lysosome hybride transitoire, qui est ensuite reconverti en lysosomes secondaires, où les hydrolases sont stockées.

En outre, les endosomes ou vorps multivésiculaires (MVE/MVB), endosomes qui accumulent à l'intérieur de petites vésicules membranaires ou vésicules intraluminales (ILV), de 60-80 nm qui contiennent le cargo :

étonné

La distinction nette entre endosomes tardifs, endo-lysosomes et lysosomes est donc souvent floue.

3. En outre, ce qui complexifie encore plus la situation, les endosomes tardifs sont aussi impliqués :

  • dans la voie de l'autophagie qui, en plus de l'endocytose et du trafic dérivé du TGN, est un point d'entrée supplémentaire dans la voie endocytaire pour la dégradation du matériel cytoplasmique, y compris les organites,
  • Isoformes des V-ATPases,phosphoinositides et pH
    Isoformes des V-ATPases, phosphoinositides et pH (levure)
    (Figure : vetopsy.fr d'après Banerjee et Kane)
    dans des contacts physiques avec d'autres organites, dont notamment le réticulum endoplasmique, via des sites de contact membranaire qui jouent un rôle clé dans mouvement des lipides, l'échange de calcium et la dynamique des endosomes (loupe contacts MVB/RE).

4. De plus, les endosomes et les lysosomes peuvent également acquérir la capacité de fusionner avec la membrane plasmique en tant qu'endo-lysosomes sécrétoires (loupe évolution des endosomes tardifs).

Caractéristiques des
endosomes tardifs

Quand on considère le modèle de " maturation endosomale ", ce processus s’accompagne de plusieurs phénomènes (Mécanismes de tri et voies de transport intracellulaire des protéines de la membrane du lysosome 2019).

Selon le type cellulaire, les éléments endocytés atteignent les endosomes précoces 1 à 5 min après endocytose, puis les endosomes tardifs après 10 à 30 min, et enfin les compartiments lytiques après environ 30 min après l’endocytose.

1. L’acidification de la lumière des compartiments par la pompe à proton V-ATPase abaisse le pH de d’environ 6,2 dans les endosomes précoces entre 4,5 et 5,5 dans les endosomes tardifs et endo-lysosomes (loupe acidité lysosomale).

livre

La V-ATPase est étudiée dans un chapitre spécial.

2. La formation de vésicules intraluminales (ILV) pour former des endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB) sont souvent synonymes d'endosomes tardifs (loupe question de nomenclature plus haut).

3. La détection, comme dans les lysosomes,

Contacts MVB/RE
Contacts MVB/RE
(Figure : vetopsy.fr d'après Wong et coll)

4. L'augmentation de la fréquence des contacts entre les endosomes et le réticulum endoplasmique régulent (Endoplasmic reticulum–endosome contact increases as endosomes traffic and mature 2013) :

Formation des endosomes tardifs

Plusieurs modèles de formation des endosomes tardifs coexistent à l'heure actuelle (loupe évolution et fonctionnement des endosomes).

Modèles de fonctionnement des endosomes
Modèles de fonctionnement des endosomes
(Figure : vetopsy.fr d'après Naslavsky et Caplan)

1. Les endosomes tardifs serait l'évolution d'un processus appelé " maturation endosomale ", depuis les vésicules d'endocytose jusqu'aux endo-lysosomes, et même jusqu'aux lysosomes.

2. Une autre théorie considère que les vésicules bourgeonnent à partir de l'endosome précoce et transportent ensuite la cargaison vers un endosome tardif plus statique, contrairement à la maturation des endosomes précoces en endosomes tardifs.

bien

Selon un semblant de consensus, les endosomes tardifs sont générés à partir de vésicules porteuses endosomales (ECV ou Endosomal Carrier Vesicle) et/ou des endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB), deux structures dérivées des endosomes précoces.

Évolution des endosomes tardifs : endo-lysosomes

1. Les endosomes tardifs peuvent fusionner avec les lysosomes, i.e. fusion hétérotypique ou fusion entre deux organites différents, mais est-ce vraiment le cas ici ?, formant ainsi un compartiment intermédiaire appelé endo-lysosome.

Remarque : certains auteurs prennent le terme endo-lysosome dans un sens général pour qualifier tous les endosomes/lysosomes. Ce n'est pas les cas dans vetopsy.fr, bien que le grand titre de ces chapitres soit système endo-lysosomal.

2. Ces endo-lysosomes qui vont évoluer :

Transformation en lysosomes

1. En règle générale, cet endo-lysosome est considéré comme l'organite intermédiaire qui se transforme en lysosome, site de dégradation des éléments contenus dans la lumière par l'apport d'hydrolases des vésicules de transport en provenance de l'appareil de Golgi trans (Endolysosomes Are the Principal Intracellular Sites of Acid Hydrolase Activity 2016).

La fusion nécessite :

2. Le modèle kiss-and-run est également impliqué.

bien

La fusion/fission membranaire est étudiée dans un chapitre spécial.

Composants et mécanismes de la taille des lysosomes
Composants et mécanismes de la taille des lysosomes
(Figure : vetopsy.fr d'après Hess et coll)

Endo-lysosomes sécrétoires

1. Les endo-lysosomes, et même les lysosomes vrais, peuvent libérer leur contenu :

  • dans le milieu extracellulaire en fusionnant avec la membrane plasmique de pratiquement tous les types de cellules, i.e. en tant qu'endo-lysosomes sécrétoires,
  • dans le cytosol.
étonné

La nomenclature est assez peu précise sur ces sujets.

Déjà qu'il n'est pas évident de distinguer endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB), endosomes tardifs, endo-lysosomes et lysosomes (loupe question de nomenclature), il faut différencier :

Régulation de TFEB et clearance cellulaire
Régulation de TFEB et clearance cellulaire
(Figure : vetopsy.fr d'après Sardiello)

2. L'exocytose lysosomale, processus menant à la sécrétion du contenu lysosomal par la fusion des lysosomes avec la membrane plasmique, est un mécanisme important de clearance cellulaire, i.e. capacité d'éliminer une substance donnée, pour maintenir un bon équilibre, pilotée par TFEB.

bien

L'exocytose lysosomale est traitée dans un chapitre spécial.

Biogenèse des endosomes multivésiculaires (MVE/MVB)
Biogenèse des endosomes multivésiculaires (MVE/MVB)
(Figure : vetopsy.fr d'après Gruenberg)

3. Les exosomes sont une classe de vésicules extracellulaires (EV), provenant du bourgeonnement de la membrane des endosomes ou corps multivésiculaires (MVE/MVB), qui ne fusionnent pas avec les lysosomes, mais sont libérés extracelluliairement sur l'exocytose.

bien

Les exosomes sont étudiés dans un chapitre spécial.

4. Les ectosomes, appelés aussi microvésicules ou microparticules, sont produits par le bourgeonnement de membrane plasmique dans différents types de cellules.

5. En outre, les machines autophagiques, conduisant en général à la séquestration de cargos cytosoliques pour leur dégradation dans les lysosomes, sont également impliquées dans la sécrétion de protéines non conventionnelles et de protéines autophagiques, i.e. mécanismes fondamentaux pour lélimination de protéines toxiques, la signalisation immunitaire et la surveillance des pathogènes.

bien

Ces processus cellulaires soulignent l'entrelacement entre le système endosomal et autophagique, entre fonctions de dégradation et de sécrétion.

Réception des protéines et des cargos dans les lysosomes
Réception des protéines et des cargos dans les lysosomes
(Figure : vetopsy.fr d'après Yang et Wang)

L'accumulation de substrats non digérés conduit à des pathologies graves comme :

Remarque : N'oublions pas, dans les organites de sécrétion, les granules sécrétoires qui tirent la majeure partie de leur contenu de l'appareil de Golgi.

Composition des endosomes tardifs