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    • Konrad Lorenz
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    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Système endo-lysosomal : endosomes précoces
Complexes de tri ou de recyclage : rétromère

Sommaire
  1. Vue d'ensemble du système endomembranaire
    1. Réticulum endoplasmique
    2. Appareil de Golgi
    3. Endosomes
    4. Lysosomes
    5. LRO (Lysosome-Related Organelle)
  2. Endosomes
    1. Vue d'ensemble des endosomes
      1. Difficultés de classification
      2. Devenirs des endosomes
      3. Caractéristiques des endosomes
      4. Évolution et fonctionnement des endosomes
    2. Endosomes précoces
      1. Vue d'ensemble des endosomes précoces
      2. Devenirs des endosomes précoces
        1. Voie de dégradation
        2. Voies de recyclage
      3. Composants des endosomes précoces
        1. Rab5 et ses régulateurs
          1. GEF dont Rabex
          2. GAP
        2. Rab5 et ses effecteurs
          1. APPL1/2
          2. EEA1
          3. Rabénosyne-5
        3. Complexes d'arrimage des endosomes précoces : complexe CORVET
        4. Complexe de tri et de recyclage des endosomes précoces
          1. Rétromère
            1. Structure du rétromère CSC
            2. Recrutement du rétromère CSC
            3. Fonctions du rétromère
          2. Nexines de tri
            1. Vue d'ensemble
            2. Nexines associées au rétromère
              1. Nexines du rétromère canonique (SNX/BAR)
                1. SNX1/2
                2. SNX5/6
              2. SNX3 et rétromère/SNX3
                1. Formation de tubules
                2. Reconnaissance du cargo
              3. SNX27 et rétromère/SNX7
                1. Formation de tubules
                2. Reconnaissance du cargo
                3. Recyclage vers la membrane
                4. SNX27 et pathologies
              4. Nexines autres que celles du rétromère
                1. SNX17
                2. SNX4
                3. ESCPE-1
                4. Autres nexines
          3. Complexe retriever
          4. Complexe CCC
          5. Complexe CHEVI
          6. Complexe FERARI
          7. Complexe WASH
            1. Structure et rôles
            2. Fonctionnement avec les complexes endosomaux
              1. avec le rétromère
              2. avec le retriever
              3. avec le CCC
            3. Mode d'action
    3. Endosomes de recyclage
    4. Vésicules intraluminales (ILV) et endosomes ou corps mutivésiculaires (MVE/MVB)
    5. Endosomes tardifs
    6. Système endo-lysosomal et phosphoinositides
    7. MCS (sites de contact membranaire) RE/endosomes/lysosomes
  3. Lysosomes
  4. Trafic des endosomes/lysosomes
    1. Vue d'ensemble du trafic
    2. Trafic antérograde (centrifuge) lié aux microtubules
    3. Trafic lié au cytosquelette d'actine
  5. Fusion et fission membranaire
  6. Transport membranaire
  7. Moteurs moléculaires
  8. Voies de signalisation

 

définition

Le rétromère est un complexe de protéines hautement conservé par l'évolution qui joue un rôle important dans le du tri et du trafic des endosomes précoces (Quick guide : retromer 2017).

Complexes endosomaux
Complexes endosomaux
(Figure : vetopsy.fr d'après Wang et all)

Le rétromère trie les protéines transmembranaires comme les récepteurs de signalisation, les canaux ioniques, les transporteurs ou les enzymes, pour leur éviter la dégradation lysosomale.

Dans les endosomes précoces, on trouve d'autres complexes qui permettent le tri ou le recyclage des cargos comme :

Vue d'ensemble

1. Le rétromère a été considéré :

bien

Chez les métazoaires, le complexe rétromère est considéré comme un " maître régulateur " du tri des protéines au niveau des membranes endosomales (Retromer: a master conductor of endosome sorting 2014).

2. Le rétromère trie les protéines transmembranaires pour leur éviter la dégradation lysosomale et les envoie :

Complexes endocytaires de l'endosome précoce
Complexes endocytaires de l'endosome précoce
(Figure : vetopsy.fr d'après Naslavsky et coll)

3. Selon les auteurs, le rétromère mammalien est un complexe formé :

  • soit par un hétérotrimère seul, CSC (Cargo Selection Complex) ou core trimer ou rétromère au sens strict, cas le plus fréquent et qui sera utilisé dans vetopsy.fr.
  • soit par un complexe plus large incluant les nexines.

Structure de l'hétérotrimère CSC

Le trimère de tri des protéines vacuolaire (VPS ou Vacuolar Protein Sorting) contient VPS35, VPS26A/VPS26B et VPS229, i.e. équivalent de Vps35, Vps26 et Vps29 de la levure (Assembly and Solution Structure of the Core Retromer Protein Complex 2010).

VPS35

Rétromère canonique
Rétromère canonique
(Figure : vetopsy.fr d'après Kianzoidlee)

1. VPS35, une protéine de 796 résidus, contient un domaine solénoïde formé par 34 hélices α (α1–34).

Pour la constitution du rétromère, VPS35 va former un hétérotrimère avec VPS26 et VPS29.

2. Toutefois, VPS35 peut se lier uniquement soit avec VPS26 ou soit avec VPS29, créant des hétérodimères (Retromer: Structure, function, and roles in mammalian disease 2015).

3. VPS35 interagit :

Remarque : une mutation de Vps35 provoque une maladie de Parkinson héréditaire d'apparition tardive.

VPS26

1. VPS26 possède un pli arrestine près de l'extrémité du domaine C-terminal qui se lie avec l'extrémité N-terminale de VPS35 sur un motif PRL/MYL (Identification of a conserved motif required for Vps35/Vps26p interaction and assembly of the retromer complex 2008)

2. La boucle flexible, β15 et β16 qui comprend des résidus hydrophobes et une glycine conservée phylogénétiquement, fournit un mécanisme d'intégration de Vps26 dans le rétromère (Structure of Vps26B and Mapping of its Interaction with the Retromer Protein Complex 2007).

Elle laisse le reste de la structure libre pour les engagements avec les membranes et pour les changements de conformation (The retromer subunit Vps26 has an arrestin fold and binds Vps35 through its C-terminal domain 2006).

Interactions VPS26-VPS35/VPS29
Interactions VPS26-VPS35/VPS29
(Figure : vetopsy.fr d'après Collins et coll)

3. VPS26 interagit :

VPS29

VPS29 possède un pli métallophosphoestérase qui se lie au pli α-solénoïde C-terminal (résidus 307-796) de VPS35 (Vps29 has a phosphoesterase fold that acts as a protein interaction scaffold for retromer assembly 2005 et Functional architecture of the retromer cargo-recognition complex 2007 et The human Vps29 retromer component is a metallo-phosphoesterase for a cation-independent mannose 6-phosphate receptor substrate peptide 2006).

nteractions Vps29/Vps35
Interactions Vps29/Vps35
(Figure : vetopsy.fr d'après Hierro et coll)

Recrutement du CSC : interactions du rétromère