Corps nucléaires
2. Corps liés à la régulation transcriptionnelle
2.1 Corps impliqués dans la maturation co-transcriptionnelle des pré-ARNm
2.1.2. Cleavage body, SAM68 body et domaine OPT
Les cleavage bodies, Sam68 bodies et domaines OPT sont des compartiments nucléaires spécialisés impliqués dans la maturation co-transcriptionnelle des ARN et la régulation post-transcriptionnelle de l’expression génique.
Machinerie CPA associée au cleavage body
(Figure : vetopsy.fr d'après Liu et Manley)
2. Les cleavage bodies participent au clivage du pré-ARNm et à l’ajout de la queue poly(A).
Cette maturation conditionne la stabilité des ARNm, leur export vers le cytoplasme et leur traduction.
3. La présence de pré-ARNm en cours de maturation dans ces compartiments et leur localisation à proximité d’autres corps nucléaires, notamment les corps de Cajal et les PML bodies, indiquent qu’ils contribuent à l’organisation spatiale des étapes post-transcriptionnelles au sein du noyau et que leur abondance varie en fonction de l’activité transcriptionnelle.
Organisation structurale et composition moléculaire
Les Sam68 bodies sont enrichis en protéines de liaison à l’ARN appartenant à la famille STAR (Signal Transduction and Activation of RNA), principalement la protéine Sam68, également appelée KHDRBS1 (KH Domain Containing, RNA Binding, Signal Transduction Associated 1), ainsi que des protéines apparentées telles que Sam68-like.
Sam68 (Src-Associated substrate in Mitosis of 68 kDa, appelée maintenant KHDRBS1 (KH Domain containing, RNA Binding, Signal transduction associated 1) possède une organisation modulaire caractéristique des protéines de la famille STAR (Sam68: A New STAR in the Male Fertility Firmament 2010).
Sam68 (KHDRBS1) et domaines KH
(Figure : vetopsy.fr d'après Hollingworth et col)
1. Le domaine STAR (Signal Transduction and Activation of RNA), d'environ 200 résidus, constitue l’élément structural et fonctionnel principal qui permet à Sam68 de former des complexes ribonucléoprotéiques et de participer à la régulation post-transcriptionnelle des ARN (Sam68, the KH domain-containing superSTAR 2003).
Le domaine KH est flanqué d'une région N-terminale (NK : 80 résidus environ) et C-terminale (CK : 30 résidus environ) qui permettent l’homodimérisation et stabilisent l’interaction avec les ARN cibles.
2. Les régions N- et C-terminales situées en dehors du domaine STAR contiennent plusieurs motifs d’interaction protéine-protéine, notamment :
Les Sam68 bodies participent à la régulation de l’épissage alternatif de certains pré-ARNm en regroupant la protéine Sam68 et des partenaires ribonucléoprotéiques qui modulent l’assemblage des complexes d’épissage sur les transcrits.
1. Sam68 agit comme une protéine régulatrice de l’épissage en se liant à des pré-ARNm spécifiques et en modulant la sélection des sites d’épissage, contribuant ainsi à la production d’isoformes protéiques distinctes selon le contexte cellulaire.
Ces compartiments participent également à la coordination entre signalisation cellulaire et métabolisme des ARN, Sam68 pouvant recruter ou organiser des complexes ribonucléoprotéiques en réponse à des signaux tels que le stress cellulaire, la prolifération ou la différenciation (Sam68 Guest STARs in TNF-α Signaling 2011).
Aperçu des fonctions spécifiques à la localisation de Sam68 et agressivité tumorale
(Figure : vetopsy.fr d'après Mendes da Silva et col)
Domaines OPT
1. Les domaines OPT sont des compartiments nucléaires sphériques de 1,0–1,5 μm de diamètre, peu nombreux, généralement présents au nombre de 1 à 3 par noyau, impliqués dans la réponse au stress de réplication et la surveillance de l’intégrité génomique.
en marqueurs de dommages de l’ADN, notamment l’histone H2AX phosphorylée (γH2AX).
2. Ces domaines se forment principalement en phase G1 autour de régions chromatiniennes ayant subi un stress de réplication lors de la phase S précédente.
