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Trafic vésiculaire
Endocytose clathrine-indépendante (CIE)
Endocytose rapide endophiline-dépendante (FEME)
Recrutement de l'endophiline, amorçage, sélection des cargos et courbure membranaire

Sommaire
définition

L'endocytose rapide endophiline-dépendante (FEME) est une endocytose indépendante de la clathrine (CIE), régulée par l'endophiline, qui permet le recrutement et l'amoçage pour le transport de cargos spécifiques.

Étapes moléculaires de la formation des transporteurs FEME
Étapes moléculaires de la formation des transporteurs FEME
(Figure : vetopsy.fr d'après Sacramento et Boucrot)

Recrutement de l'endophiline

Dans les cellules au repos, l'endophiline est préenrichie en petits patchs à des emplacements discrets sur la membrane plasmique.

1. La grande majorité des molécules d'endophiline sont auto-inhibées dans le cytosol par le biais d'interactions intra-dimères entre les hélices H0 et le domaine SH3 des différentes sous-unités au sein des homodimères (Intradimer/Intermolecular Interactions Suggest Autoinhibition Mechanism in Endophilin A1 2014).

L'engagement du domaine SH3 avec un motif riche en proline (PRM ou PRD) est nécessaire et suffisant pour lever l'auto-inhibition et pour que le domaine N-BAR puisse se lier à la membrane pour détecter, stabiliser ou induire une courbure membranaire locale.

2. Les amas d'endophiline sur la membrane plasmique dépendent de la production de Pi(3,4)P2 à partir de précurseurs Pi(4,5)P2 et Pi(3,4,5)P3.

Ils sont donc imposants au bord d'attaque des cellules migratrices, mais sont également nombreux sur les surfaces ventrales et dorsales des cellules.

3. Les amas d'endophiline sur la membrane plasmique des cellules au repos sont dynamiques et durent de 5 à 15 s avant leur désassemblage si l'endocytose n'a pas lieu.

Amorçage (priming)

La FEME est déclenchée par une série d'événements moléculaires initiée par Cdc42, une petite GTPase de la famille Rho.

1. Le Cdc42, avec GTP, recrute les protéines CIP4 (Cdc42-Interacting Protein4) et FBP17 (Formin Binding Protein17) par leur domaine REM/HR1 qui se concentrent sur la membrane lors de la liaison de leurs domaines F-BAR et de leur hétérodimérisation (FBP17 and CIP4 recruit SHIP2 and Lamellipodin to prime the plasma membrane for Fast Endophilin-Mediated Endocytosis 2018).

Stabilisation du cou vésiculaire
Stabilisation du cou vésiculaire
(Figure : vetopsy.fr d'après Mondal et coll)

Dans certaines cellules, TOCA1 (Transducer of Cdc42-dependent actin assembly protein 1) pourrait être impliquée dans cette étape, car elle s'hétérodimérise à la fois avec FBP17 et CIP4, et tous les trois sont fonctionnellement redondants dans la FEME (Investigation of the Interaction between Cdc42 and Its Effector TOCA1 2016).

2. CIP4 (Cdc42-Interacting Protein4) et FBP17 recrutent, via leur domaine SH3, SHiP1/2 (SH2-containing inositol Phosphatase 1/2) et la lamellipodine (LPD).

Remarque : la lamellipodine (LPD), comme son nom l'indique, est une protéine essentielle à la migration et au cycle cellulaire (Lamellipodin tunes cell migration by stabilizing protrusions and promoting adhesion formation 2020 et Mechanosensitive expression of lamellipodin promotes intracellular stiffness, cyclin expression and cell proliferation 2021 et Lamellipodin promotes actin assembly by clustering Ena/VASP proteins and tethering them to actin filaments 2015).

Structure de la lamellipodine (LPD)
Structure de la lamellipodine (LPD)
(Figure : vetopsy.fr d'après Wang et coll)

La LPD possède plusieurs motifs riches en proline (PRM ou PRD) et est, en outre, stabilisée par PI(3,4)P2 produit localement par SHIP1/2 (Endophilin, Lamellipodin, and Mena cooperate to regulate F-actin-dependent EGF-receptor endocytosis 2013).

3. L'endophiline A se lie aux régions de la LPD, concentrant ainsi l'endophiline en plaques dans la membrane plasmique.

Modèle résumant le cycle d'amorçage de FEME dans les cellules au repos
Modèle résumant le cycle d'amorçage de FEME dans les cellules au repos
(Figure : vetopsy.fr d'après Chan Wah Hak et coll)
bien

Ces trois événements sont des étapes obligatoires qui doivent se produire de manière séquentielle.

L'épuisement de l'une quelconque de ces protéines délimite le processus en aval de l'étape visée, qui bloque invariablement la formation de vecteur FEME lors de l'activation du récepteur.

4. En l'absence d'activation des récepteurs, les patchs d'endophiline se désassemblent rapidement en 5 à 15 secondes après le recrutement local des GAP (GTPase-Activating Protein ou GTPase-Accelerating Protein) de Cdc42, Rich1, Sh3BP1 ou Oligophrénine-6.

Condensats formés par l'endophiline
Condensats formés par l'endophiline
(Figure : vetopsy.fr d'après Mondal et coll)

5. Récemment, la séparation de phase liquide-liquide (LLPS) a été mise en évidence et pourrait être un mécanisme clé pour l'assemblage des protéines pendant la FEME.

a. La LLPS favorise la formation de clusters enrichis d'endophiline sur la membrane qui peuvent agir comme des sites d'initiation pour la FEME.

Les condensats de type liquide recrutent ensuite des protéines d'endocytose supplémentaires telles que les récepteurs activés.

b. La LLPS des endophilines, principalement formée par les domaines BAR et les domaines SH3, favorise également la liaison des protéines à motifs riches en proline dans le condensat (Multivalent interactions between molecular components involved in fast endophilin mediated endocytosis drive protein phase separation 2022).

Sélection des cargos par l'endophiline

De nombreux récepteurs possèdent de grandes queues cytoplasmiques (Mechanisms of carrier formation during Clathrin-independent endocytosis 2018).

1. À ce jour, 16 cargos FEME ont été découverts :

Endocytoses A3 et A2-dépendantes
Endocytoses A3 et A2-dépendantes
(Figure : vetopsy.fr d'après Renard et coll)

Remarque : cependant, de nombreux cargos peuvent également utiliser d'autres voies endocytaires pour entrer dans les cellules, par exemple par CME, CLIC/GEEC, EGFR-NCE ou macropinocytose.

2. Lors de la formation rapide de transporteurs FEME, i.e. l'endophiline peut se lier :

Remarque : l'endocytose impliquant l'endophiline A3 implique une galectine-8 comme dans l'internalisation de CD166/ALCAM (Endophilin-A3 and Galectin-8 control the clathrin-independent endocytosis of CD166 2020).

Récepteurs couplés aux protéines G (GPCR)

1. Les récepteurs couplés aux protéines G (GPCR) contiennent des motifs riches en proline (PRM ou PRD), présents dans la troisième boucle intracellulaire (TIL) de leurs parties cytoplasmiques, comme dans les (Endophilin marks and controls a clathrin- independent endocytic pathway 2015) :

2. Le domaine SH3 de l'endophiline se lie à ces motifs PRM.

Les dimères d'endophiline relient directement la membrane par l'intermédiaire de leurs domaines BAR aux effecteurs cytosoliques et aux cargos par l'intermédiaire de leurs domaines SH3.

Récepteurs à activité tyrosine kinase (RTK)

L'endophiline se lie indirectement aux récepteurs à activité tyrosine kinase (RTK) par l'intermédiaire d'une protéine adaptatrice reconnaissant des motifs dans leurs queues cytoplasmiques.

1. Dans le cas de l'EGFR (Epidermal Growth Factor Receptor) et HGFR (Hepatocyte Growth Factor Receptor), seuls les récepteurs activés, i.e. dimérisés et transphosphorylés, sont reconnus par Cbl par son domaine SH2, qui est à son tour lié par les complexes CIN85-Endophiline.

L’internalisation de l’EGFR dépend de la concentration d’EGF.

2. Dans la FEME, l’EGFR activé recrute les ubiquitines ligases de la famille Cbl, (Casitas B-lineage lymphoma), dont c-Cbl qui serait recrutée par Grb2 (Growth factor receptor-bound protein 2) qui interagit directement avec les tyrosines phosphorylées 1068 et 1086 de l’EGFR (Cbl–CIN85–endophilin complex mediates ligand-induced downregulation of EGF receptors 2002).

  • Cbl se lie aux tyrosines phosphorylées et est, en retour, phosphorylée par le récepteur.
  • Cette phosphorylation permet le recrutement de la protéine adaptatrice CIN85/SH3KBP1 qui est associée aux endophilines, et le complexe CIN85/EGFR/endophilines ainsi formé entraine l’endocytose du récepteur stimulé.

La déplétion de Cbl ou de CIN85 inhibe la formation des EPA induits par l’EGF (Endophilin marks and controls a clathrin- independent endocytic pathway 2015).

Endocytoses de l'EGFR
Endocytoses de l'EGFR
(Figure : vetopsy.fr d'après Boucrot et coll)

Remarque : EGFR peut aussi être endocyté par la voie EGFR-NCE (Non Clathrin-Endocytosis), qui est activée à concentrations élevées et cible les récepteurs de la dégradation, les lysosomes, atténuant la signalisation.

3. L'endophiline se lie au récepteur TrkB (Tropomyosin receptor kinase B) du BDNF (Brain-derived neurotrophic factor) par l'adaptateur cytosolique rétrolinkine (Retrolinkin cooperates with endophilin A1 to mediate BDNF–TrkB early endocytic trafficking and signaling from early endosomes 2011).

La petite GTPase Rab10 contrôle le tri et la propagation de TrkB et de la signalisation BDNF des terminaux axonaux au soma (Rab10 regulates the sorting of internalised TrkB for retrograde axonal transport 2021).

Remarque : les récepteurs de guidance axonale se lient à d'autres adaptateurs :

Courbure de la membrane par l'endophiline

Le processus de courbure de la membrane dans la FEME n'est pas encore complètement identifié.

1. L'endophiline et son domaine N-BAR sont nécessaires, car en leur absence, aucun transporteur FEME n'est produit.

2. Cependant, la transition entre les plaques primitives de l'endophiline, qui ne semblent pas générer de courbure significative, et la mise en forme des tubules et des vésicules après l'activation des récepteurs ne sont pas comprises, i.e. les patchs d'endophiline dans les cellules au repos ne correspondent pas aux invaginations membranaires.

  • Soit les patchs primitifs n'atteignent pas une concentration locale critique d'endophiline nécessaire pour déformer la membrane plasmique, et l'activation du récepteur augmente le nombre de molécules d'endophiline au-dessus du seuil.
  • Soit, jusqu'à présent, un mécanisme non identifié contrôle la courbure de la membrane par le domaine N-BAR jusqu'à l'activation.
  • Soit la courbure nécessite la présence d'une autre protéine.

Bin1 est une autre protéine N-BAR présente sur pratiquement tous les transporteurs FEME, mais aussi sur la plupart des patchs d'amorçage, de sorte que son recrutement n'est pas le déclencheur en soi (loupe régulation de la FEME).

3. La polymérisation de l'actine pourrait avoir un rôle dans l'induction ou la stabilisation de la courbure de la membrane au cours de la formation des tubules.

Mais isoler son rôle lors de l'amorçage (priming), la formation de courbure de la membrane, la scission de membrane et le transport cytosolique potentiel à courte distance est techniquement difficile.

Formation des transporteurs FEME

La formation des transporteurs FEME implique :