• Comportement du chien et
    du chat
  • Celui qui connait vraiment les animaux est par là même capable de comprendre pleinement le caractère unique de l'homme
    • Konrad Lorenz
  • Biologie, neurosciences et
    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Acides aminés
Vue d'ensemble

  1. Biochimie
    1. Chimie organique
    2. Bioénergétique
    3. Composition de la matière vivante
      1. Composés organiques
        1. Protides
          1. Acides aminés
          2. Protéines
            1. Glycoprotéines
              1. Protéoglycanes
                1. Classification des protéoglycanes
                2. Syndécanes (SDC)
            2. Scléroprotéines (protéines fibreuses)
          3. Domaines protéiques
          4. Modifications des protéines
          5. Dégradations des protéines
        2. Acides nucléiques
        3. Glucides
        4. Lipides
        5. Hormones
        6. Composés inorganiques
  2. Transport membranaire
  3. Moteurs moléculaires
  4. Voies de signalisation

 

définition

Un acide aminé (aa) est un acide carboxylique qui possède également un groupe amine.

Les acides aminés sont très bien décrits sur Wikipedia : nous ne les détaillerons pas et dans vetopsy.fr, nous renverrons à chaque fois à leur description sur cette plateforme.

1. Plus de 500 acides aminés naturels ont été découverts et constituent les briques des peptides (loupe Norine, database des peptides).

Structure générale d'un acide aminé
Structure générale d'un acide aminé
(Figure : vetopsy.fr)

2. 22 apparaissent dans le code génétique :

  • 20 ont leurs propres codons,
  • 2 ont des mécanismes de codage spéciaux : sélénocystéine présente chez tous les eucaryotes et pyrrolysine présente chez certains procaryotes.

Classification des acides aminés

Les acides aminés sont classés de différentes manières, i.e. en fonction de :

1. la position du groupe amine par rapport au groupe carboxyle en distinguant par exemple les acides α-aminés, β-aminés, γ-aminés ou δ-aminés,

2. leur polarité, i.e. façon dont les charges électriques négatives et positives sont réparties dans une molécule ou une liaison chimique,

3. leur ionisation,

4. leur nature :

5. la présence de groupes fonctionnels autres que le carboxyle (-COOH) et l'amine (-NH) qui définissent cette classe de composés.

Remarque : les acides aminés sont retrouvés sous deux formes (loupe chiralité et énantiomères) :

  • les L ou lévogyres bien plus abondants, i.e. la lumière est déviée vers la gauche d'un angle -α,
  • les D ou dextrogyres bien plus rares, i.e. appelés aussi α, la lumière est déviée vers la droite d'un angle α.
acides aminés
Acides aminés
(Figure : vetopsy.fr d'après TungstenEinsteinium)

Liste des acides aminés principaux

Acide aminé Symboles Chaîne latérale
  3 1 Classe Polairité Charge à pH 7,4
Alanine Ala A Aliphatique Non polaire Neutre
Arginine Arg R Cation fixe Basique polaire Positive
Asparagine Asn N Amide Polaire Neutre
Acide aspartique
(aspartate)
Asp D Anion Base de Brønsted Négative
Cystéine Cys C Thiol Brønsted acid Neutre
Glutamine Gln Q Amide Polaire Neutre
Acide glutamique
(glutamate)
Glu E Anion Base de Brønsted Négative
Glycine Gly G Aliphatique Non polaire Neutre
Histidine His H Cation Aromatique Acide et base
de Brønsted
Positive (10%)
Neutre (90% )
Isoleucine Ile I Aliphatique Non polaire Neutre
Leucine Leu L Aliphatique Non polaire Neutre
Lysine Lys K Cation Acide de Brønsted Positive
Méthionine Met M Thioéther Non polaire Neutre
Phénylalanine Phe F Aromatique Non polaire Neutre
Proline Pro P Cyclique Non polaire Neutre
Sérine Ser S Hydroxylique Polaire Neutre
Thréonine Thr T Hydroxylique Polaire Neutre
Tryptophane Trp W Aromatique Non polaire Neutre
Tyrosine Tyr Y Aromatique Acide de Brønsted Neutre
Valine Val V Aliphatique Non polaire Neutre