Glycoprotéines
Protéoglycanes (PG)
Classification

Vue d'ensemble de la classification des protéoglycanes

Contrairement à la classification des glycosaminoglycanes (GAG), principalement basée sur la structure chimique de leurs unités disaccharidiques répétitives, la classification des protéoglycanes est une tâche beaucoup plus complexe.

1. Les GAG étant classés en quatre groupes, en fonction de leurs structures disaccharidiques centrales, les protéoglycanes peuvent être à base :

• de HSPG (Heparan Sulfate ProteoGlycan), i.e. formé d'héparine/héparane sulfate (HS), (Heparan Sulfate Proteoglycans 2011)
• de CSPG, i.e. formé de chondroïtine sulfate (CS),
• de DSPG, i.e. formé de dermatane sulfate (DS),
• de KSPG, i.e. formé de kératane sulfate (KS),.

2. Une autre classification peut être basée sur trois critères :

• la localisation cellulaire et subcellulaire,
• l'homologie globale gène/protéine,
• la présence de modules protéiques spécifiques dans leurs noyaux protéiques respectifs.

Le troisième critère est de développement plus récent et représente une sorte de " signature intrinsèque " pour divers noyaux protéiques.

• La conception modulaire est basée sur le concept simple selon lequel les cœurs de protéines sont constitués d'unités finies, comme des morceaux de Lego.
• Les unités représentent un niveau minimum d'organisation et un module peut être considéré comme un domaine fonctionnel qui affecte la dynamique cellule-matrice.
• Chaque module/unité fonctionnelle peut être stable et peut se replier sur lui-même, sans faire partie de la grande protéine précurseur. Ainsi, un module est un composant autonome.

Classification des protéoglycanes

Quatre grandes classes de protéoglycanes englobent presque tous les protéoglycanes connus du génome des mammifères :

• les PG intracellulaires,
• les PG de surface cellulaire,
• les PG péricellulaires,
• les PG extracellulaires.

Localisation	Gène	Nom	GAG prédominat	Module protéique
Protéoglycanes (PG) intracellulaires
Granules sécrétoires	SRGN	Serglycine	Hep
Protéoglycanes (PG) de la suface cellulaire
Transmembrane	SDC	Syndécanes 1-4	HS
	CSPG4	NG2 (CSPG4)	CS
	TGFBR3	β-glucanes	CS/HS
	PTPRZ1	Phosphacane	CS
Ancre GPI	GPC	Glypicanes 1-6	HS
Protéoglycanes (PG) péricellulaires
Membrane basale	HSPG2	Perlécan	HS
	AGRN	Agrine	HS
	COL18A1	Collagène XVIII	HS
	COL15A1	Collagène XV	CS/HS
Protéoglycanes (PG) extracellulaires
Hyalectane/ Lecticanes	ACAN	Agrécane	CS/KS
	VCAN	Versicane	KS
	NCAN	Neurocane	KS
	BCAN	Brévicane	KS
SLRP (Soluble LRP) canoniques (Classe I)	BGN	Biglycane	CS
	DCN	Décorine	DS
	ASPN	Asporine
	ECM2	ECM2
	ECMX	ECMX
SLRP canoniques (Classe I)I	FMOD	Fibromoduline	KS
	LUM	Lumicane	KS
	PRELP	Prolargine
	KERA	Kératocane	KS
	OMD	Ostéocadhérine	KS
SLRP canoniques (Classe III)	EPYC	Épiphycan	DS/CS
	OPT	Opticine
	OGN	Ostéoglycine
SLRP non canoniques (Classe IV)	CHAD	Chondocadhérine
	NYX	Nyctalopine
	TSKU	Tsukushi
SLRP non canoniques (Classe V)	PODN	Podocane
	PODNL1	Podocane-like 1
SPOCK	SPOCK	Testicane 1-3	HS