Domaines protéiques
Domaine immunoglobuline (Ig)

Les membres de cette superfamille sont impliqués dans un grand nombre de fonctions, comme :

• la motilité et la réorganisation du cytosquelette,
• la prolifération et la différenciation cellulaire, le développement neuronal,
• la réponse immunitaire.

Domaine Ig

Les domaines Ig comprennent 70 à 110 acides aminés et sont classés en fonction de leur taille et de la fonction (Ig-like domains: Evolution from simple interaction molecules to sophisticated antigen recognition 1999).

1. Le domaine est formé de deux feuillets de brins β antiparallèles dont les interactions, qui stabilisent l'ensemble, sont sous-tendues par :

• des acides aminés hydrophobes,
• un ponts disulfure hautement conservé par les cystéines entre les brins B et F (The immunoglobulin fold. Structural classification, sequence patterns and common core 1994).

2. Les domaines de type Ig peuvent être classés en :

• domaines variables : IgV qui comptent 9 brins β ;
• domaines constants : IgC1 et IgC2, qui n'en comptent que 7 ;

Les IgC2 ont une structure primaine proche des IgV, mais sont de la taille des IGC.

• domaines intermédiaires ou IgI.

Remarque : des domaines à structure similaire sont appelés immunoglobuline-like comme, par exemple, le domaine ML (MD-2-related lipid-recognition) qui compte 7 brins β présents dans NPC2.

Récepteurs à domaine Ig

Ces récepteurs comprennent plusieurs régions.

1. La région extracellulaire contient en général différents domaines Ig.

• Le plus éloigné, qui est un domaine IgV, contient le site du récepteur aux ligands.
• Puis, on trouve des domaines IgC qui relient le récepteur à la membrane.

2. Les récepteurs à domaines Ig :

• présentent le plus souvent une seule hélice α transmembranaire,
• sont ancrés grâce à du glycosylphosphatidylinositol (GPI) à la membrane.

3. Le domaine intracellulaire est court et contient :

• soit des motifs de liaison pour des molécules qui interviennent dans la signalisation intracellulaire comme les kinases ou les protéines adaptatrices,
• soit des domaines de phosphorylation tridimensionnellement structurés.

Protéines à domaine Ig

Les protéines à domaine Ig comprennent :

• les récepteurs d'antigène de surface cellulaire,
• les co-récepteurs et les molécules de co-stimulation du système immunitaire,
• des molécules impliquées dans la présentation des antigènes aux lymphocytes,
• des molécules d'adhésion cellulaire, par leur propension à dimériser (cis et trans),
• certains récepteurs de cytokines et de protéines musculaires intracellulaires,
• les canaux sodium voltage-dépendants.

Izumo, protéine spécifique du sperme, seule protéine membranaire essentielle à la fusion du spermatozoïde/ovule, en fait aussi partie (The immunoglobulin superfamily protein Izumo is required for sperm to fuse with eggs 2005).

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