Protéine kinases
Sérine/thréonine kinases : vue d'ensemble

Une des classifications des PK est tributaire de l'acide aminé phosphorylé ( classifications utilisées) et comprend :

• Les sérine/thréonine kinases (EC 2.7.11),

• 

  Les tyrosine kinases qui comportent :
  • les RTK (Receptor Tyrosine Kinases), récepteurs membranaires tyrosine kinase (EC 2.7.10.1),
  • les nRTK (non-Receptor Tyrosine Kinase) cytosoliques, même si certaines sont ancrées à la membrane cellulaire par modification post-traductionnelle N-terminale (EC 2.7.10.2) ;
• Les dual-specific kinases (DSK) sont à la fois des sérine/thréonine kinases et des tyrosine kinases (EC 2.7.12.1).
• Les histidine kinases retrouvées principalement chez les Procaryotes (EC 2.7.13.3).

Vue d'ensemble des sérine/thréonine kinases

Les sérine/thréonine kinase (EC 2.7.11) ajoutent un groupe phosphate au groupe hydroxyle (-OH) de la sérine ou/et de la thréonine.

$\ce{ATP + protéine-Ser/Thr}$ $\leftrightharpoons$ $\ce{ADP + protéine-pSer/pThr}$

1. Un grand nombre de ces kinases sont non spécifiques (EC 2.7.11.1), d'autres sont souvent très importantes font partie de la famille des protéine-kinases AGC, à structure du domaine kinase très proche (AGC protein kinases: From structural mechanism of regulation to allosteric drug development for the treatment of human diseases 2013) :

• cAMP-dependent comme PKA (EC 2.7.11.11),
• cGMP-dependent somme PKG (EC 2.7.11.12),
• protein kinase C comme PKC (EC 2.7.11.13).

Les kinases AGC sont caractérisées par trois sites de phosphorylation conservés qui servent de commutateurs pour contrôler les interactions intra et inter-moléculaires, régulant ainsi leur fonction (Crystal Structure and Allosteric Activation of Protein Kinase C βII 2011).

• Le premier est situé dans une boucle d'activation au centre du domaine kinase.
• Les deux autres sites de phosphorylation sont situés en dehors du domaine kinase dans une région conservée sur son côté C-terminal, le domaine C-terminal AGC-kinase.

2. Les sérine/thréonine kinases, comme les tyrosine kinases, comprennent :

• des récepteurs protéine sérine/thréonine kinase (EC 2.7.11.30),
• des peptides et protéines de signalisation intracellulaires.

3. Les sérine/thréonine kinases sont régulées :

• par la phosphorylation d'autres kinases,
• par la liaison à d'autres protéines,
• par auto-inhibition,
• par des voies de signalisation comme celles des petites GTPases qui provoquent une cascade d'événements.

Tyrosine kinases