Système endo-lysosomal : nexines du rétromère (3)
SNX27 : structure et formation de tubules
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- Vue d'ensemble des endosomes précoces
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- Composants des endosomes précoces
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- Rab5 et ses effecteurs
- Complexes d'arrimage des endosomes précoces : complexe CORVET
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Le rétromère et ses complexes affiliés, i.e. retriever et CCC, jouent un rôle important dans la modulation du trafic endocytaire classique et dans la régulation de l'homéostasie mitochondriale (
fonctions du rétromère).
(Figure : vetopsy.fr d'après Vieira et coll)
1. Le rétromère canonique (rétromère/SNX-BAR) est attaché à un dimère de nexine appartenant à la sous-famille BAR :
- SNX1 ou SNX2, i.e. équivalent à Vps5 de la levure,
- SNX5, SNX6, i.e. équivalent à Vps17 de la levure.
2. Le rétromère/SNX3 est formé par le rétromère CSC lié à SNX3, une nexine contenant seulement un domaine PX (sous-famille PX-only).
Ces deux voies de transport rétrograde conduisent les cargos au réseau trans-Golgi (TGN) via le réseau de microtubules (Microtubule motors mediate endosomal sorting by maintaining functional domain organization 2013).
3. Le rétromère/SNX27 est formé par le rétromère CSC lié à SNX27, une nexine appartenant à la sous-famille FERM.
Cette voie recycle les cargos directement vers la membrane plasmique via le réseau de microtubules.
Remarque : Snx17 est impliqué dans le complexe retriever, un complexe rétromère-like.
La complexité de la biologie des rétromères chez les métazoaires reflète probablement à la fois l'augmentation du nombre de cargos et la diversité des routes de trafic à partir des endosomes.
(Figure : vetopsy.fr d'après Wang et all)
Rétromère/SNX27
Ce chapitre est largement inspiré de : Toward Understanding the Molecular Role of SNX27/Retromer in Human Health and Disease (2021).
1. Le rétromère/SNX27 est formé par le rétromère CSC lié à SNX27, une nexine appartenant à la sous-famille FERM.
SNX27 sert d'adaptateur reliant certains cargos aux tubules endosomaux pour les recycler vers la membrane plasmique (Toward Understanding the Molecular Role of SNX27/Retromer in Human Health and Disease 2021).
(Figure : vetopsy.fr d'après Chandra et coll)
2. SNX27 contient :
- un domaine PX,
- un domaine FERM,
- un domaine PDZ.
SNX27 et formation de tubules
1. Comme SNX3, SNX27 utilise son domaine PX pour s'attacher à la membrane et pourrait former des microtubules (Architecture and mechanism of metazoan retromer:SNX3 tubular coat assembly 2021).
2. Toutefois, SNX27 contient d'autres domaines, i.e. PDZ et FERM, qui pourraient entraîner des contraintes supplémentaires lors de l'engagement du rétromère.
(Figure : vetopsy.fr d'après Chandra et coll)
Le rétromère/SNX27 pourrait produire des arcs similaires à ceux du rétromère/SNX3 car son domaine PX contient des résidus conservés qui lui permettraient de s'accrocher aux membranes de manière similaire (SNX3 et formation de tubules).
- Dans ce scénario, les domaines PX et PDZ semblent être suffisamment proches pour que leurs liens connectent les deux domaines.
- Les études sur l'emplacement et l'orientation du domaine FERM sont encore en cours.
SNX27 ne pourrait pas se lier au rétromère/SNX-BAR.
- Les dimères BAR adjacents à la membrane peuvent bloquer ou obstruer le domaine PDZ, qui lui-même doit lier les motifs de cargaison intégrés dans la membrane.
- Cependant, le rétromère/SNX-BAR a été fonctionnellement lié à la formation de porteurs rétromère/SNX27 ( A global analysis of SNX27-retromer assembly and cargo specificity reveals a function in glucose and metal ion transport 2013).
3. Le rétromère des métazoaires forme des oligomères in vitro, y compris des chaînes plus longues et plus plates, avec des liens VPS26 (Endosomal Sorting: Architecture of the Retromer Coat 2018) . En outre, il semblerait que les tubules aient des diamètres légèrement différents.
(Figure : vetopsy.fr d'après Kendall et coll)
Le rétromère, avec différentes nexines pourrait former des tubules de dimensions différentes qui fournirait aux cellules un moyen de diriger ou de séquestrer physiquement les cargos vers divers supports tubulaires provenant des endosomes.
SNX27 et reconnaissance des cargos
Biologie cellulaire et moléculaireMembrane plasmiqueNoyauCytoplasmeMitochondriesSystème endomembranaireRéticulum endoplasmiqueAppareil de GolgiEndosomesLysosomesPeroxysomesProtéasomesCytosqueletteMicrofilaments d'actineFilaments intermédiairesMicrotubulesMatrice extracellulaireReproduction cellulaireBiochimieTransport membranaireMoteurs moléculairesVoies de signalisation