• Comportement du chien et
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    • Konrad Lorenz
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    sciences en général
  •  Le but des sciences n'est pas d'ouvrir une porte à la sagesse infinie,
    mais de poser une limite à l'erreur infinie
    • La vie de Galilée de Bertold Brecht

Système endo-lysosomal : endosomes précoces
Complexes de tri ou de recyclage : fonctions du rétromère

Sommaire
  1. Vue d'ensemble du système endomembranaire
    1. Réticulum endoplasmique
    2. Appareil de Golgi
    3. Endosomes
    4. Lysosomes
    5. LRO (Lysosome-Related Organelle)
  2. Endosomes
    1. Vue d'ensemble des endosomes
      1. Difficultés de classification
      2. Devenirs des endosomes
      3. Caractéristiques des endosomes
      4. Évolution et fonctionnement des endosomes
    2. Endosomes précoces
      1. Vue d'ensemble des endosomes précoces
      2. Devenirs des endosomes précoces
        1. Voie de dégradation
        2. Voies de recyclage
      3. Composants des endosomes précoces
        1. Rab5 et ses régulateurs
          1. GEF dont Rabex
          2. GAP
        2. Rab5 et ses effecteurs
          1. APPL1/2
          2. EEA1
          3. Rabénosyne-5
        3. Complexes d'arrimage des endosomes précoces : complexe CORVET
        4. Complexe de tri et de recyclage des endosomes précoces
          1. Rétromère
            1. Structure du rétromère CSC
            2. Recrutement du rétromère CSC
            3. Fonctions du rétromère
          2. Nexines de tri
            1. Vue d'ensemble
            2. Nexines associées au rétromère
              1. Nexines du rétromère canonique (SNX/BAR)
                1. SNX1/2
                2. SNX5/6
              2. SNX3 et rétromère/SNX3
                1. Formation de tubules
                2. Reconnaissance du cargo
              3. SNX27 et rétromère/SNX7
                1. Formation de tubules
                2. Reconnaissance du cargo
                3. Recyclage vers la membrane
                4. SNX27 et pathologies
              4. Nexines autres que celles du rétromère
                1. SNX17
                2. SNX4
                3. ESCPE-1
                4. Autres nexines
          3. Complexe retriever
          4. Complexe CCC
          5. Complexe CHEVI
          6. Complexe FERARI
          7. Complexe WASH
            1. Structure et rôles
            2. Fonctionnement avec les complexes endosomaux
              1. avec le rétromère
              2. avec le retriever
              3. avec le CCC
            3. Mode d'action
    3. Endosomes de recyclage
    4. Vésicules intraluminales (ILV) et endosomes ou corps mutivésiculaires (MVE/MVB)
    5. Endosomes tardifs
    6. Système endo-lysosomal et phosphoinositides
    7. MCS (sites de contact membranaire) RE/endosomes/lysosomes
  3. Lysosomes
  4. Trafic des endosomes/lysosomes
    1. Vue d'ensemble du trafic
    2. Trafic antérograde (centrifuge) lié aux microtubules
    3. Trafic lié au cytosquelette d'actine
  5. Fusion et fission membranaire
  6. Transport membranaire
  7. Moteurs moléculaires
  8. Voies de signalisation

 

définition

Le rétromère et ses complexes affiliés, i.e. retriever et CCC, jouent un rôle important :

Complexes endosomaux
Complexes endosomaux
(Figure : vetopsy.fr d'après Wang et all)

Modulation du trafic
endocytaire

Vésiculation et
tubulation

1. Le rétromère intervient dans la nucléation de l'actine pour fournir la force requise pour la vésiculation, la tubulation et la fission des membranes endosomales (loupeComplexe WASH, complexes endosomaux et polymérisation de l'actine).

2. Les protéines EHD (EH domain-containing protein) contenant un domaine EH (Eps15 Homology) C-terminale ont été impliquées (loupe endosomes de recyclage et EHD)

Modèle de biogenèse de la tubulation des endosomes de recyclage
Modèle de biogenèse de la tubulation des endosomes de recyclage
(Figure : vetopsy.fr d'après Giridharan et coll)

Fission vésiculaire

1. On ne sait pas encore précisément quel partenaire participe à la fission des tubules et des vésicules contenant le rétromère (The enigmatic endosome - sorting the ins and outs of endocytic trafficking 2018) :

Complexes endocytairesde l'endosome précoce
Complexes endocytaires de l'endosome précoce
(Figure : vetopsy.fr d'après Naslavsky et coll)

2. EHD1 pourrait être impliqué dans la formation d'un complexe de scission qui recruterait, dans les vésicules bourgeonnantes ou dans les tubules, les complexes comme le rétromère par l'intermédiaire de ses partenaires d'interaction comme (EHDs meet the retromer 2012) :

Sous-familles des nexines dans le tri des cargos
Sous-familles des nexines
(Figure : vetopsy.fr d'après Hanley et Cooper)

Dans ce modèle, l'activité d'hydrolyse de l'ATPase d'EHD1 pourrait induire une fission d'une manière similaire à celle médiée par sa GTPase homologue, i.e. la dynamine 2.

En plus, son activité de nucléation de l'actine est initiée par le complexe WASH et Arp2/3 et une protéine motrice potentielle comme la dynéine, attachée à la dynactine tirant sur le bourgeon en formation (loupe Mode d'action du complexe WASH).

Rétromère et trafic

1. Le rétromère et ses complexes affiliés jouent un rôle important dans la modulation du trafic endocytaire classique.

2. Toutefois, plusieurs exemples de nexines de tri, autres que celles du rétromère, et leurs partenaires d'interaction, ainsi que des GAP comme ACAP1 sont impliquées ans le trafic des endosomes précoces.

Régulation de l'homéostasie
mitochondriale

1. Les protéines régulatrices endocytaires comme la dynamine 2, le rétromère et EHD1 (EH domain-containing protein 1, testilin ou PAST1), régulent toutes l'homéostasie mitochondriale (Tying trafficking to fusion and fission at the mighty mitochondria 2018).

Rôles de Vps35 dans la fusion et la fission mitochondriale
Rôles de Vps35 dans la fusion et la fission mitochondriale
(Figure : vetopsy.fr d'après Farmer et coll)

1. Le transport médié par Vps35 de la GTPase Drp1 (Dynamin related protein 1, appelée aussi DNM1L) est essentiel pour l'homéostasie de la membrane mitochondriale (Vps35 Mediates Vesicle Transport between the Mitochondria and Peroxisomes 2010 et Control of mitochondrial homeostasis by endocytic regulatory proteins 2017 et VPS35 Deficiency or Mutation Causes Dopaminergic Neuronal Loss by Impairing Mitochondrial Fusion and Function 2015).

bien

Drp1/Dnm1, la fission et la fusion mitochondriale sont étudiées dans des chapitres spéciaux.

2. Un modèle a été proposé.

Remarque : en outre, Rab5 subit une translocation vers la membrane mitochondriale lors d'un stress oxydatif (Rab5 and Alsin regulate stress-activated cytoprotective signaling on mitochondria 2018et Rab GTPases: The Key Players in the Molecular Pathway of Parkinson’s Disease 2017).

Autres complexes de tri ou de recyclage

Dans les endosomes précoces, on trouve d'autres complexes qui permettent le tri ou le recyclage des cargos comme :