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Protéines
Dégradation : protéolyse (catabolisme protéique)

Sommaire
  1. Biologie cellulaire et moléculaire
    1. Cellules procaryotes et eucaryotes
    2. Structure générale d'une cellule eucaryote
  2. Constituants de la cellule
  3. Matrice extracellulaire
  4. Reproduction cellulaire
  5. Biochimie
    1. Composition de la matière vivante
      1. Composés organiques
        1. Protides
          1. Acides aminés
          2. Protéines
            1. Structure des protéines
            2. Domaines des protéines
            3. Modifications post-traductionnelles
              1. Addition d'un groupe fonctionnel
                1. Addition par une enzyme
                  1. Groupes hydrophobes pour la localisation membranaire
                    1. Isoprénylation (prénylation)
                    2. Palmitoylation
                    3. Glypiation
                  2. Cofacteurs pour améliorer l'activité enzymatique
                  3. Groupes chimiques
                2. Addition non-enzymatique
              2. Autres protéines ou peptides
                1. Système ubiquitine-protéasome (UPS)
                  1. Ubiquitination
                    1. Ubiquitine
                    2. E3 ubiquitine ligases
                      1. Famile HECT
                      2. Famile RING
                      3. Famille RBR
                    3. Mécanismes de l'ubiquitination
                      1. E1 (ubiquitin-activating enzyme)
                      2. E2 (ubiquitin-conjugating enzyme)
                      3. Variantes du mécanisme général
                      4. Mono et polyubiquitination
                    4. Rôles de l'biquitination
                      1. Dégradation de la protéine ubiquitinée
                      2. Autres rôles
                      3. Interactions protéine/protéine
                      4. Endocytose
                      5. Rôles dans le noyau
                    5. Désubiquitination
                      1. Désubiquinases (DUB)
                        1. Classification des DUB
                        2. Structure des DUB
                      2. Modes de déusbiquitination des DUB
                      3. Mécanismes de la désubiquitination
                        1. Protéases à cystéine
                        2. Métalloprotéases à zinc
                      4. Régulations des DUB
                      5. Fonctions des DUB
                    6. Voie N-end rule : règle N-terminale
                      1. Vue d'ensemble et définitions
                      2. Branches de la règle du N-terminal
                        1. Ac/règle N-terminale (Ac/N-end rule)
                        2. Arg/règle N-terminale (Arg/N-end rule)
                2. Système ubiquitine-like (UBL)
                  1. Membres des UBL
                    1. Protéines jouant différents rôles
                    2. Protéines jouant un rôle dans l'autophagie
                  2. Structure des UBL
                  3. Sumoylation
                    1. Protéines SUMO
                    2. Mécanismes de la sumoylation
                      1. SENP (sentrin- ou SUMO-specific proteases)
                      2. E1 et E2
                      3. E3 ligases éventuelles
                  4. Neddylation
              3. Modifications structurales
            4. Dégradation des protéines
        2. Acides nucléiques
        3. Glucides
        4. Lipides
        5. Vitamines
        6. Enzymes
        7. Coenzymes
        8. Hormones
      2. Composés inorganiques
        1. Eau
        2. Minéraux
        3. Oligoéléments
        4. Ions
  6. Transport membranaire
  7. Moteurs moléculaires
  8. Voies de signalisation

Bibliographie

définition

La protéolyse est la dégradation des protéines en petits polypeptides ou en acides aminés

Cette protéolyse constitue la principale source d’acides aminés pour l’organisme (75 % contre 25 % pour les apports). Elle est, en général, assurée par des peptidases (protéases ou enzymes protéolytiques) qui sont classées parmi les hydrolases.

Protéolyse
Protéolyse
(Figure : vetopsy.fr)

Les autres processus peuvent être la digestion intra-moléculaire, ainsi que la protéolyse par des températures élevées ou par des pH bas.

Vue d'ensemble

Plusieurs dispositifs enzymatiques, qui comprennent chacun leur spécificité, sont à l'oeuvre :

Protéases (peptidases ou enzymes protéolytiques)

Biologie cellulaire et moléculaireConstituants de la celluleBiochimieProtidesAcides aminésProtéinesStructure des protéinesDomaines des protéinesModifications post-traductionnellesDégradation des protéinesGlucidesLipidesEnzymesHormonesTransport membranaireMoteurs moléculairesVoies de signalisation

Bibliographie
  • Marieb E. N. - Anatomie et physiologie humaines - De Boeck Université, Saint-Laurent, 1054 p., 1993
  • Maillet M. - Biologie cellulaire - Abrégés de Masson, 512 p, 2002
  • Lodish et coll - Biologie moléculaire de la cellule - De Boeck Supérieur, Saint-Laurent, 1207 p., 2014